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-I. -I.. -g -O2 -c --emit-llvm wcsprintf.c -o wcsprintf.bc llvm-gcc -std=gnu99 -DHAVE_CONFIG_H -I. -I.. -g -O2 -c --emit-llvm wcstrig.c -o wcstrig.bc llvm-gcc -std=gnu99 -DHAVE_CONFIG_H -I. -I.. -g -O2 -c --emit-llvm wcsulex.c -o wcsulex.bc llvm-gcc -std=gnu99 -DHAVE_CONFIG_H -I. -I.. -g -O2 -c --emit-llvm wcsunits.c -o wcsunits.bc llvm-gcc -std=gnu99 -DHAVE_CONFIG_H -I. -I.. -g -O2 -c --emit-llvm wcsutil.c -o wcsutil.bc llvm-gcc -std=gnu99 -DHAVE_CONFIG_H -I. -I.. -g -O2 -c --emit-llvm wcsutrn.c -o wcsutrn.bc llvm-ld -link-as-library -strip-all -o libwcslib.bc cel.bc fitshdr.bc lin.bc log.bc prj.bc spc.bc sph.bc spx.bc tab.bc wcs.bc wcsbth.bc wcsfix.bc wcshdr.bc wcspih.bc wcsprintf.bc wcstrig.bc wcsulex.bc wcsunits.bc wcsutil.bc wcsutrn.bc cp libwcslib.bc /home/user/dev/install/bc/ cd /home/user/dev/Duchamp-1.1.13/ echo "Compiling duchamp" llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/mainDuchamp.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/mainDuchamp.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/duchamp.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/duchamp.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/param.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/param.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/fitsHeader.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/fitsHeader.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/PixelMap/Voxel.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/PixelMap/Voxel.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/PixelMap/Scan.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/PixelMap/Scan.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/PixelMap/Object2D.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/PixelMap/Object2D.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/PixelMap/Object3D.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/PixelMap/Object3D.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/ATrous/filter.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/ATrous/filter.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/ATrous/atrous_1d_reconstruct.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/ATrous/atrous_1d_reconstruct.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c 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-I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Detection/detection.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Detection/columns.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Detection/columns.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Detection/ObjectGrower.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Detection/ObjectGrower.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Detection/areClose.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Detection/areClose.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Detection/growObject.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Detection/growObject.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Detection/lutz_detect.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Detection/lutz_detect.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Detection/mergeIntoList.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Detection/mergeIntoList.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Detection/outputDetection.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Detection/outputDetection.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Detection/sorting.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Detection/sorting.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Detection/spectrumDetect.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Detection/spectrumDetect.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/cubes.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/cubes.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/cubes_extended.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/cubes_extended.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/baseline.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/baseline.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/CubicSearch.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/CubicSearch.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/detectionIO.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/detectionIO.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/existingDetections.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/existingDetections.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/getImage.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/getImage.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/invertCube.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/invertCube.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/Merger.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/Merger.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/momentMap.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/momentMap.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/readRecon.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/readRecon.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/readSmooth.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/readSmooth.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/saveImage.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/saveImage.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/smoothCube.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/smoothCube.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/spectraUtils.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/spectraUtils.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/trimImage.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/trimImage.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Cubes/VOTable.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Cubes/VOTable.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/FitsIO/Beam.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/FitsIO/Beam.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/FitsIO/DuchampBeam.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/FitsIO/DuchampBeam.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/FitsIO/dataIO.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/FitsIO/dataIO.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/FitsIO/headerIO.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/FitsIO/headerIO.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/FitsIO/subsection.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/FitsIO/subsection.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/FitsIO/wcsIO.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/FitsIO/wcsIO.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/Section.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/Section.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/Statistics.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/Statistics.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/feedback.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/feedback.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/GaussSmooth1D.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/GaussSmooth1D.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/Hanning.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/Hanning.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/getStats.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/getStats.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/getNormalStats.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/getNormalStats.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/getRobustStats.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/getRobustStats.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/linear_regression.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/linear_regression.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/position_related.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/position_related.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/sort.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/sort.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/string_related.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/string_related.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/wcsFunctions.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/wcsFunctions.bc llvm-g++ -O2 -ftree-vectorize --emit-llvm -c src/Utils/zscale.cc -I/home/user/dev/install/include -I/home/user/dev/install/include/wcslib -I/home/user/dev/install/include -I./src -o src/Utils/zscale.bc llvm-ld -disable-opt -o Duchamp ./src/mainDuchamp.bc 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./src/Cubes/smoothCube.bc ./src/Cubes/spectraUtils.bc ./src/Cubes/trimImage.bc ./src/Cubes/VOTable.bc ./src/FitsIO/Beam.bc ./src/FitsIO/DuchampBeam.bc ./src/FitsIO/dataIO.bc ./src/FitsIO/headerIO.bc ./src/FitsIO/subsection.bc ./src/FitsIO/wcsIO.bc ./src/Utils/Section.bc ./src/Utils/Statistics.bc ./src/Utils/feedback.bc ./src/Utils/GaussSmooth1D.bc ./src/Utils/Hanning.bc ./src/Utils/getStats.bc ./src/Utils/getNormalStats.bc ./src/Utils/getRobustStats.bc ./src/Utils/linear_regression.bc ./src/Utils/position_related.bc ./src/Utils/sort.bc ./src/Utils/string_related.bc ./src/Utils/wcsFunctions.bc ./src/Utils/zscale.bc /home/user/dev/install/bc/libwcslib.bc /home/user/dev/install/bc/libcfitsio.bc opt -S -disable-inlining -O2 -std-compile-opts -std-link-opts -o Duchamp.ll Duchamp.bc